除了林丹汗的苏巴海福晋、俄尔哲图福晋，弟弟粆图台吉遗失草原之中，斯琴图福晋、窦土门福晋、兀浪哈大公主、泰松公主、贵英恰（乌云娜福晋的哥哥）都先后投向娜木钟，娜木钟封斯琴图福晋、窦土门福晋、乌云娜福晋三人为王太妃，后来都随娜木钟侍候薛云，皆为薛云的后妃，乌云娜产下一女封公主。
苏泰大福晋、额哲众叛亲离，对娜木钟恨之入骨，暗中勾结建虏皇太极，以传国玉玺为进身台级，投靠建虏皇太极，崇祯八年六月，皇太极命多尔衮、岳托、豪格领兵一万女真精锐，偷偷前往鄂尔多斯迎接苏泰大福晋、额哲，十月底苏泰大福晋、额哲只带着三千部族和传国玉玺，随多尔衮、岳托、豪格来到了金国盛京，皇太极纳苏泰大福晋为妃，封额哲额尔克孔果尔，安置在鸭绿江西岸靠近朝鲜义州的地方，后封额哲为亲王，并将皇女马喀塔格格嫁给了他。
得到传国玉玺的皇太极认为天命有归，积极筹备登基称帝，代善、阿敏都暗中鄙视，阿济格、多尔衮、多铎都觉得时间不成熟，可是岳托、济尔哈朗、豪格却极力拥戴，八旗将领个个希图从龙之功，汉臣李永芳、范家主等频频劝进。
大明崇祯九年四月十一日，爱新觉罗·皇太极在盛京称帝，皇太极改女真族名为满州，建国号大清，年号崇德，是年为崇德元年，众臣上尊号宽温仁圣皇帝，然后是大封功臣，四月二十六日，崇德皇帝皇太极派多罗武英郡王阿济格为首领等统八旗兵十万伐明。
阿济格兵分三路入喜峰口、独石口，大明巡关御史王肇坤拒战兵败阵亡，明军退至昌平防守，清兵再侵居庸、昌平北路，京营总兵王朴驰援，传说击斩一千一百零四人，俘获一百四十三人。
八天后建虏三路大军会于北京延庆县，连败明军七阵，俘获人畜一万三千多，七月初三日，北京全城戒严，清军经延庆入居庸关，取昌平，守城总兵巢丕昌投降，明德陵被焚毁，大军直逼北京西直门下。
崇祯皇帝大惊，急命文武大臣分守都城各门，命兵部尚书张凤翼总督各镇援兵，让太监高起潜为监军，然而各镇勤王军未到，即使有出击的机会高起潜也不敢一战，上层官员如此贪生怕死，难怪下面将士畏敌如虎，一遇清军便望风丧胆退缩不前。
清军无意攻打京师，依太宗方针，在京城周围不断劫掠，消耗明军实力，七月清军攻陷昌平后，又相继攻下良乡、围攻顺义。明顺义知县上官荩与游击治国器、都指挥苏时雨等城陷皆战死，清军乘势又攻下宝坻、定兴、安肃、大城、雄县、安州等近畿州县。
第841章 高迎祥败亡
清军至八月底，共攻克十二座城池，大小五十余战战战皆胜，劫获人畜近二十万，就有财物无数，这时大明的勤王军连续到来，阿齐格顾虑大同的薛家军横插一杠子，于九月一日，携带掠获的二十万人畜及其大批物资从容出冷口，他们还砍下木头，写上“各官免送”字样扔于路旁，戏虐明朝文武官员。
大批的人畜物资用了四天才全部走出关外，明军怯战怕中清军诱敌圈套，眼睁睁看着清军满载而归，清军出关后，兵部尚书张凤翼装模作样的向崇祯报告：“斩敌三级”，朝廷言官纷纷上书弹劾张凤翼，张凤翼自知必遭重罪，深恨官军不肯用命，不愿入诏狱服大黄麻死于军营里。
勤王军中皆没有功力，唯有远道而来的四川石柱宣抚使秦良玉，崇祯皇帝喜她剿贼累立战功，又肯数千远道勤王忠心可嘉，当下晋封秦良玉一品夫人酬功，并亲制诗章作为特别的宠赐。
不过阿济格也没有占到太大的便宜，有道是螳螂捕蝉黄雀在后，早就等在关外的薛家军和蒙古军一拥而上，硬生生从阿济格手里抢人畜物资，一般常识撤退时应该精兵殿后，阿齐格竟将辎重放在后面，自己率领精锐前行，薛家军和蒙古军杀到，阿济格眼睁睁看着自己抢来的人畜物资被抢劫一空。
阿济格惧怕薛家军竟不敢回军作战，任由薛家军和蒙古军满载人畜物资而归，阿济格只带得两成的人畜物资返回盛京，皇太极得知阿济格犯了兵家大忌后，将骄傲轻敌的阿齐格狠狠训斥了一通，考虑到是遇上薛家军，皇太极并没有处惩阿济格，既然抢大明便宜不大，皇太极把贪婪的目光盯在了相邻的朝鲜国身上。
崇祯皇帝重赏女英雄秦良玉之后，又把目光放在了另一个勤王将领右副都御史兼湖广总督兵部侍郎卢象升，于九月二十二日任命卢象升为总督宣大、山西军务，卢象升知道总督宣大、山西军务除去大同、绛州两地，根本就是一个半残的总督，卢象升要求辞去总督宣大、山西军务一职，卢象升要求跟崇祯面谈面谈，也没有获得崇祯皇帝的同意，只是口谕卢象升相机处置大同、绛州两地的薛家军。
卢象升只好垂头丧气的去宣府上任，不过薛家军很给卢象升面子，把抢劫回来的人畜物资送给卢象升处理，这让卢象升非常意外，怀疑以前朝廷对薛家军的政策有误，卢象升秉公遣送发还人畜物资，没有让京畿的百姓再受一次伤，而宣大、山西地区的气氛也和缓许多，薛家军和卢象升都在打着各自的主意。
这时大明朝也有一件喜事，就是陕西巡抚孙传庭在崇祯九年七月，陕西子午谷的黑水峪之战中打了起义军中势力最强的高迎祥部，并俘虏了闯王高迎祥，崇祯得知高迎祥被俘的消息非常高兴，命令陕西巡抚孙传庭将高迎祥押往北京，并举行了的献俘仪式，仪式之后闯王高迎祥被凌迟处死。
原来崇祯九年正月，农民军闯王高迎祥、闯将李自成率部东围庐州，取含山、和州；农民军连营数十里攻滁州，被右副都御史兼湖广总督兵部侍郎卢象升率领边兵总兵祖宽、游击罗岱等败于城东五里桥，农民军战不利，连营俱溃，北退五十里，被斩一千二百余级。
之后农民军屡战屡败，从朱龙关至关山，积尸埴沟委堑，滁水为不流，农民军失利后，北渡淮河泗州、徐州，农民军损失惨重，开始分路向河南境内溃退，卢象升急速追入河南境内围剿农民军，农民军最后逃入南阳府的内乡、淅川山中，三月中旬，闯王等又纷纷杀回陕西。
卢象升急速追入河南，布置各军围剿，一时河南境内，杀声震天，血肉横飞。农民军最后逃入南阳府的内乡、淅川山中，卢象升奈何不得。至此年三月，闯王高迎祥、闯将李自成等又纷纷杀回陕西。
不久建虏皇太极派多罗武英郡王阿济格为首领等统八旗兵十万伐明，明朝大军的重心转向京畿，右副都御史兼湖广总督兵部侍郎卢象升也挥师北上勤王，三月由右佥都御史顺天府府丞孙传庭替代剿贼无功的甘学阔出任了陕西巡抚，崇祯皇帝这回总算启用了一个文武全才的秦督。
孙传庭军事、经济都是行家里手，孙传庭主持陕西军务后，不断扩充自己的军力和粮饷，在西安周围屯田二万余项，从两万多官军中，选得精锐士卒一万一千人，税银、粮食都有所增加。
闯王高迎祥、闯将李自成逃回陕西后，孙传庭与洪承畴进行了工作分工，洪承畴重点对付陕北一带的闯将李自成等部，孙传庭则重点对付闯王高迎祥，高迎祥部退入陕南山区之后，由于这几年陕西、山西连年遭受旱灾、虫灾，发生大饥荒。饥民无粮，只得食树皮、草叶，树皮、草叶尽，乃人相食，甚有母烹其女以食者，闯王高迎祥在陕南山区无处觅食，人饥马乏，为摆脱困境，他决定走小路进攻西安，给官军来一个突然袭击。
谙熟兵法的孙传庭得知闯王高迎祥部突然消失，就猜到高迎祥欲效三国时蜀国大将魏延之计从子午谷出奇兵，子午谷是秦岭六条连接西南的大道中最险峻的一条，历史上多次有兵家企图偷渡，但却从来没有人成功过，孙传庭立刻做出军事部署，在闯王高迎祥部必经之路周至县黑水峪设置伏兵，准备以逸击劳歼灭闯王高迎祥部。
崇祯九年七月中旬，闯王高迎祥部果然出现在周至黑水峪，进入了孙传庭的包围圈，双方展开了四天的激战，此时天降大雨，高迎祥部已经连续多日断粮，人马处于半饥饿状态，在大战中渐渐招架不住，官军的包围圈越来越小。
关键时刻闯王高迎祥部下乾公鸡张二、一斗谷黄龙叛变。混乱中叛徒将高迎祥的部卒和坐骑拉走，高迎祥被官军包围无法脱身，只好脱下盔甲藏到草丛里，官军搜山将高迎祥生擒活捉。
孙传庭又乘胜在渭南和咸阳北原打了两个大胜仗，一时间是声誉鹊起，威名甚至盖过了总督洪承畴，高迎祥的败亡对民军起到了震摄的作用，农民军大首领张妙手、蝎子块向孙传庭投降，不久蝎子块复叛，被孙传庭安插的武大定杀死，农民军以高迎祥部实力最强的，蝎子块人数最多的，这两人都死于孙传庭之手，对农民军是一个沉重的打击。
五省总督洪承畴的运气就比较差，刚刚接手对付陕北一带的闯将李自成等部，宁夏镇士兵，因兵饷无措发生兵变，饥兵群起围攻官署。巡抚右佥都御史王楫因不能措饷，饥兵索饷无着鼓噪而杀之。
兵备副使丁启睿得都司熊大海之助率军镇压，捕获为首者七人，立即处斩，兵变才被抚定，丁启睿叙功保举熊大海为参将，熊大海与副将罗尚文击杀农民军整齐王于商洛山中，五月，副将罗尚文击杀整齐王于商洛山中。五月，熊大海配合贺人龙又于安定大败李自成部，丁启睿在熊大海身上得利不少，崇祯十一年冬，陕西巡抚孙传庭北上勤王，丁启睿升任右佥都御史，代孙传庭巡抚陕西。
李自成部在崇祯九年九月在汉中再次失利后，逃入四川、陕西、湖北的崇山峻岭，李自成收罗高迎祥旧部自称闯王，至崇祯十一年初才重回陕西。但不久李自成部在潼关一带连遭败绩，于此年八月率残部躲入川、陕、湖广省交界的山区，如果不是陕西巡抚孙传庭北上勤王，估计李自成难逃孙传庭的毒手。
闯王高迎祥、闯将李自成一死一败之后，崇祯皇帝加大了对张献忠、闻香教、建文后裔“奉天正义大元帅”部，张献忠所部遂成为潼关以东地区官军攻击的主要目标，张献忠所部转战于湖北、河南、安徽，多次打破官军围追堵截，入河南袭破许州，杀掉了左良玉的哥哥游击潘可大等人，缴获物资巨万，可是张献忠独木难支，开始跟官军媾和，准备用假招安欺骗朝廷。
闻香教虽然有杭州薛家军的武器支持，可自己控制的汝宁府资源有限，几年大战下来，闻香教几乎无兵可招，这时徐鸿儒发现自己被薛家军当了枪使，高迎祥、张献忠、李自成失利后，河南官军副将陈永福、参将薛十三、客军参将薛综偷袭了闻香教都城商城。
闻香教都城商城被破后，官军四处杀人放火，中兴福烈帝徐鸿儒从皇宫中逃出，被参将薛十三追上一阵混战，徐鸿儒虽然武功高强，奈何也不是铜筋铁骨，身中多出刀伤箭伤，被大元帅徐三姐抢走，大将军徐老七殿后被薛综部斩为肉泥。
崇祯九年十月十七日，中兴福烈帝徐鸿儒伤重毙命，大元帅徐三姐收拾到残部不足一万人，后勤辎重家属教民几乎损失怡尽，在颍上被追来的河南副将陈永福一阵厮杀，徐三姐只带着三千多轻骑逃往中都凤阳府。
崇祯九年十月，福建参将郑芝豹得到援军后，配合浙江、河南官军围剿“奉天正义大元帅”所部，三路大军属河南方面的薛家军最为彪悍，薛十三、薛综和新加入的薛博部，追着“奉天正义大将军”黄希达打。
黄希达虽然拥有四万军队，可面对薛十三、薛综、薛博的八千人马竟然七战七败，四万人马剩下不足一万人，而大本营金华府也被福建官军攻破，“奉天正义大元帅”白衣书生下落不明，至此黄希达开始在浙江打游击，有的黄家子弟也暗中联络家主黄希圣。
第842章 朝鲜降清
崇祯九年十二月二日，皇太极以朝鲜大王李倧拒不接见大清使团，不接受其国书，朝鲜使臣罗德宪、李廓参加皇太极在沈阳正式举行的称帝大典拒不下拜为由，皇太极派济尔哈朗守盛京，阿济格、阿巴泰守辽河入海口以遏薛家军、明军，令多尔衮、豪格分统左翼满洲、蒙古兵，从宽甸入长山口；户部承政马福塔等率兵三百人突袭朝鲜王都，多铎、岳托等人率数千兵马接应，皇太极亲自与大贝勒代善率其他各路人马共十二万大军征伐朝鲜。
清军渡江后，扬野战之长，舍坚城而不攻，长驱而南下，仅仅十二天便抵达朝鲜京城下，京畿之内“上下惶惶，罔知所为，都城士大夫，扶老携幼，哭声载路”；朝鲜大王李倧再次将王妃、王子和大臣妻子送往江华岛避难，自己则率领文武百官退守南汉山城，同时派出崔鸣吉等人赴清营谈判拖延时间，等待各路勤王军的到来。
这时朝鲜大帅张晚已经病逝，出任主将的李贵一面率领四万大军勤王，一面向在旅顺的薛家军求救，因为是兵马万户伊朝芳的防区被建虏突破，急于将功赎罪的伊朝芳未到朝鲜京城，就被岳托、豪格消灭了，吓得李贵率部躲回平壤再也不敢出城。
李贵、伊朝芳的人马是朝鲜最精锐的，现在李贵、伊朝芳的人马一败，整个朝鲜根本没有能跟建虏一战的军队，各路勤王军都畏惧不前，崇祯十年正月，清兵先后击败全罗道、忠清道等地的援军后，朝鲜大王李倧真心向清军求和。
皇太极恐朝鲜再次反清，遣多尔衮袭破江华岛，俘虏朝鲜王妃、王子、宗室、群臣家属，皇太极要求朝鲜大王李倧出城投降，朝鲜大王李倧得知江华岛失陷，知道大势已去只好求和。崇祯十年年正月三十日，朝鲜大王李倧脱去王服改穿青衣率领群臣出南汉山城，徒步前往汉江东岸的三田浦清营向皇太极行三跪九叩之礼请罪。皇太极降旨赦之。
双方筑坛盟誓，朝鲜去明年号，缴纳明朝所赐诰命敕印，奉清朝为正朔，定时贡献，并送质子二人。此外朝鲜大王李倧亲明反清的主要人物弘文馆校理尹集、修撰吴达济及台谏官洪翼汉缚献清军，三人后来在盛京被建虏杀害。
满清和朝鲜双方签订和议：朝鲜大王李倧以长子李溰、次子李淏赴清朝作人质，每年黄金百两、白银千两、水牛角二百对、貂皮百张、鹿皮百张、茶千包、水獭皮四百张、青黍皮三百张、胡椒十斗、腰刀二十六口、顺刀二十口、苏木二百斤、大纸千卷、小纸千五百卷、五爪龙席四领、花席四十领、白苎布二百疋、绵绸二千疋、细麻布四百疋、细布万疋、布四千疋、米万包。
满清还不满意，将五十万朝鲜人作为俘虏押回国充作奴隶，并掠走朝鲜大量物资，后来朝鲜大王李倧向满清支付赎金赎回了一些人；朝鲜被迫与明朝和薛家军断交，接受满清的册封，成为清朝的藩属国，皇太极命令朝鲜出兵旅顺，朝鲜大王李倧出战船五十艘协助满清攻打旅顺的薛家军。
旅顺的薛家军得知建虏进攻朝鲜，还是捐弃前嫌出兵助战，陆要金、左明、游参将出兵辽东，阿济格、阿巴泰率领正黄旗、正蓝旗固守，薛家军虽然小有斩获，却不想朝鲜已经向满清投降了。
苏泰大福晋、额哲众叛亲离，对娜木钟恨之入骨，暗中勾结建虏皇太极，以传国玉玺为进身台级，投靠建虏皇太极，崇祯八年六月，皇太极命多尔衮、岳托、豪格领兵一万女真精锐，偷偷前往鄂尔多斯迎接苏泰大福晋、额哲，十月底苏泰大福晋、额哲只带着三千部族和传国玉玺，随多尔衮、岳托、豪格来到了金国盛京，皇太极纳苏泰大福晋为妃，封额哲额尔克孔果尔，安置在鸭绿江西岸靠近朝鲜义州的地方，后封额哲为亲王，并将皇女马喀塔格格嫁给了他。
得到传国玉玺的皇太极认为天命有归，积极筹备登基称帝，代善、阿敏都暗中鄙视，阿济格、多尔衮、多铎都觉得时间不成熟，可是岳托、济尔哈朗、豪格却极力拥戴，八旗将领个个希图从龙之功，汉臣李永芳、范家主等频频劝进。
大明崇祯九年四月十一日，爱新觉罗·皇太极在盛京称帝，皇太极改女真族名为满州，建国号大清，年号崇德，是年为崇德元年，众臣上尊号宽温仁圣皇帝，然后是大封功臣，四月二十六日，崇德皇帝皇太极派多罗武英郡王阿济格为首领等统八旗兵十万伐明。
阿济格兵分三路入喜峰口、独石口，大明巡关御史王肇坤拒战兵败阵亡，明军退至昌平防守，清兵再侵居庸、昌平北路，京营总兵王朴驰援，传说击斩一千一百零四人，俘获一百四十三人。
八天后建虏三路大军会于北京延庆县，连败明军七阵，俘获人畜一万三千多，七月初三日，北京全城戒严，清军经延庆入居庸关，取昌平，守城总兵巢丕昌投降，明德陵被焚毁，大军直逼北京西直门下。
崇祯皇帝大惊，急命文武大臣分守都城各门，命兵部尚书张凤翼总督各镇援兵，让太监高起潜为监军，然而各镇勤王军未到，即使有出击的机会高起潜也不敢一战，上层官员如此贪生怕死，难怪下面将士畏敌如虎，一遇清军便望风丧胆退缩不前。
清军无意攻打京师，依太宗方针，在京城周围不断劫掠，消耗明军实力，七月清军攻陷昌平后，又相继攻下良乡、围攻顺义。明顺义知县上官荩与游击治国器、都指挥苏时雨等城陷皆战死，清军乘势又攻下宝坻、定兴、安肃、大城、雄县、安州等近畿州县。
第841章 高迎祥败亡
清军至八月底，共攻克十二座城池，大小五十余战战战皆胜，劫获人畜近二十万，就有财物无数，这时大明的勤王军连续到来，阿齐格顾虑大同的薛家军横插一杠子，于九月一日，携带掠获的二十万人畜及其大批物资从容出冷口，他们还砍下木头，写上“各官免送”字样扔于路旁，戏虐明朝文武官员。
大批的人畜物资用了四天才全部走出关外，明军怯战怕中清军诱敌圈套，眼睁睁看着清军满载而归，清军出关后，兵部尚书张凤翼装模作样的向崇祯报告：“斩敌三级”，朝廷言官纷纷上书弹劾张凤翼，张凤翼自知必遭重罪，深恨官军不肯用命，不愿入诏狱服大黄麻死于军营里。
勤王军中皆没有功力，唯有远道而来的四川石柱宣抚使秦良玉，崇祯皇帝喜她剿贼累立战功，又肯数千远道勤王忠心可嘉，当下晋封秦良玉一品夫人酬功，并亲制诗章作为特别的宠赐。
不过阿济格也没有占到太大的便宜，有道是螳螂捕蝉黄雀在后，早就等在关外的薛家军和蒙古军一拥而上，硬生生从阿济格手里抢人畜物资，一般常识撤退时应该精兵殿后，阿齐格竟将辎重放在后面，自己率领精锐前行，薛家军和蒙古军杀到，阿济格眼睁睁看着自己抢来的人畜物资被抢劫一空。
阿济格惧怕薛家军竟不敢回军作战，任由薛家军和蒙古军满载人畜物资而归，阿济格只带得两成的人畜物资返回盛京，皇太极得知阿济格犯了兵家大忌后，将骄傲轻敌的阿齐格狠狠训斥了一通，考虑到是遇上薛家军，皇太极并没有处惩阿济格，既然抢大明便宜不大，皇太极把贪婪的目光盯在了相邻的朝鲜国身上。
崇祯皇帝重赏女英雄秦良玉之后，又把目光放在了另一个勤王将领右副都御史兼湖广总督兵部侍郎卢象升，于九月二十二日任命卢象升为总督宣大、山西军务，卢象升知道总督宣大、山西军务除去大同、绛州两地，根本就是一个半残的总督，卢象升要求辞去总督宣大、山西军务一职，卢象升要求跟崇祯面谈面谈，也没有获得崇祯皇帝的同意，只是口谕卢象升相机处置大同、绛州两地的薛家军。
卢象升只好垂头丧气的去宣府上任，不过薛家军很给卢象升面子，把抢劫回来的人畜物资送给卢象升处理，这让卢象升非常意外，怀疑以前朝廷对薛家军的政策有误，卢象升秉公遣送发还人畜物资，没有让京畿的百姓再受一次伤，而宣大、山西地区的气氛也和缓许多，薛家军和卢象升都在打着各自的主意。
这时大明朝也有一件喜事，就是陕西巡抚孙传庭在崇祯九年七月，陕西子午谷的黑水峪之战中打了起义军中势力最强的高迎祥部，并俘虏了闯王高迎祥，崇祯得知高迎祥被俘的消息非常高兴，命令陕西巡抚孙传庭将高迎祥押往北京，并举行了的献俘仪式，仪式之后闯王高迎祥被凌迟处死。
原来崇祯九年正月，农民军闯王高迎祥、闯将李自成率部东围庐州，取含山、和州；农民军连营数十里攻滁州，被右副都御史兼湖广总督兵部侍郎卢象升率领边兵总兵祖宽、游击罗岱等败于城东五里桥，农民军战不利，连营俱溃，北退五十里，被斩一千二百余级。
之后农民军屡战屡败，从朱龙关至关山，积尸埴沟委堑，滁水为不流，农民军失利后，北渡淮河泗州、徐州，农民军损失惨重，开始分路向河南境内溃退，卢象升急速追入河南境内围剿农民军，农民军最后逃入南阳府的内乡、淅川山中，三月中旬，闯王等又纷纷杀回陕西。
卢象升急速追入河南，布置各军围剿，一时河南境内，杀声震天，血肉横飞。农民军最后逃入南阳府的内乡、淅川山中，卢象升奈何不得。至此年三月，闯王高迎祥、闯将李自成等又纷纷杀回陕西。
不久建虏皇太极派多罗武英郡王阿济格为首领等统八旗兵十万伐明，明朝大军的重心转向京畿，右副都御史兼湖广总督兵部侍郎卢象升也挥师北上勤王，三月由右佥都御史顺天府府丞孙传庭替代剿贼无功的甘学阔出任了陕西巡抚，崇祯皇帝这回总算启用了一个文武全才的秦督。
孙传庭军事、经济都是行家里手，孙传庭主持陕西军务后，不断扩充自己的军力和粮饷，在西安周围屯田二万余项，从两万多官军中，选得精锐士卒一万一千人，税银、粮食都有所增加。
闯王高迎祥、闯将李自成逃回陕西后，孙传庭与洪承畴进行了工作分工，洪承畴重点对付陕北一带的闯将李自成等部，孙传庭则重点对付闯王高迎祥，高迎祥部退入陕南山区之后，由于这几年陕西、山西连年遭受旱灾、虫灾，发生大饥荒。饥民无粮，只得食树皮、草叶，树皮、草叶尽，乃人相食，甚有母烹其女以食者，闯王高迎祥在陕南山区无处觅食，人饥马乏，为摆脱困境，他决定走小路进攻西安，给官军来一个突然袭击。
谙熟兵法的孙传庭得知闯王高迎祥部突然消失，就猜到高迎祥欲效三国时蜀国大将魏延之计从子午谷出奇兵，子午谷是秦岭六条连接西南的大道中最险峻的一条，历史上多次有兵家企图偷渡，但却从来没有人成功过，孙传庭立刻做出军事部署，在闯王高迎祥部必经之路周至县黑水峪设置伏兵，准备以逸击劳歼灭闯王高迎祥部。
崇祯九年七月中旬，闯王高迎祥部果然出现在周至黑水峪，进入了孙传庭的包围圈，双方展开了四天的激战，此时天降大雨，高迎祥部已经连续多日断粮，人马处于半饥饿状态，在大战中渐渐招架不住，官军的包围圈越来越小。
关键时刻闯王高迎祥部下乾公鸡张二、一斗谷黄龙叛变。混乱中叛徒将高迎祥的部卒和坐骑拉走，高迎祥被官军包围无法脱身，只好脱下盔甲藏到草丛里，官军搜山将高迎祥生擒活捉。
孙传庭又乘胜在渭南和咸阳北原打了两个大胜仗，一时间是声誉鹊起，威名甚至盖过了总督洪承畴，高迎祥的败亡对民军起到了震摄的作用，农民军大首领张妙手、蝎子块向孙传庭投降，不久蝎子块复叛，被孙传庭安插的武大定杀死，农民军以高迎祥部实力最强的，蝎子块人数最多的，这两人都死于孙传庭之手，对农民军是一个沉重的打击。
五省总督洪承畴的运气就比较差，刚刚接手对付陕北一带的闯将李自成等部，宁夏镇士兵，因兵饷无措发生兵变，饥兵群起围攻官署。巡抚右佥都御史王楫因不能措饷，饥兵索饷无着鼓噪而杀之。
兵备副使丁启睿得都司熊大海之助率军镇压，捕获为首者七人，立即处斩，兵变才被抚定，丁启睿叙功保举熊大海为参将，熊大海与副将罗尚文击杀农民军整齐王于商洛山中，五月，副将罗尚文击杀整齐王于商洛山中。五月，熊大海配合贺人龙又于安定大败李自成部，丁启睿在熊大海身上得利不少，崇祯十一年冬，陕西巡抚孙传庭北上勤王，丁启睿升任右佥都御史，代孙传庭巡抚陕西。
李自成部在崇祯九年九月在汉中再次失利后，逃入四川、陕西、湖北的崇山峻岭，李自成收罗高迎祥旧部自称闯王，至崇祯十一年初才重回陕西。但不久李自成部在潼关一带连遭败绩，于此年八月率残部躲入川、陕、湖广省交界的山区，如果不是陕西巡抚孙传庭北上勤王，估计李自成难逃孙传庭的毒手。
闯王高迎祥、闯将李自成一死一败之后，崇祯皇帝加大了对张献忠、闻香教、建文后裔“奉天正义大元帅”部，张献忠所部遂成为潼关以东地区官军攻击的主要目标，张献忠所部转战于湖北、河南、安徽，多次打破官军围追堵截，入河南袭破许州，杀掉了左良玉的哥哥游击潘可大等人，缴获物资巨万，可是张献忠独木难支，开始跟官军媾和，准备用假招安欺骗朝廷。
闻香教虽然有杭州薛家军的武器支持，可自己控制的汝宁府资源有限，几年大战下来，闻香教几乎无兵可招，这时徐鸿儒发现自己被薛家军当了枪使，高迎祥、张献忠、李自成失利后，河南官军副将陈永福、参将薛十三、客军参将薛综偷袭了闻香教都城商城。
闻香教都城商城被破后，官军四处杀人放火，中兴福烈帝徐鸿儒从皇宫中逃出，被参将薛十三追上一阵混战，徐鸿儒虽然武功高强，奈何也不是铜筋铁骨，身中多出刀伤箭伤，被大元帅徐三姐抢走，大将军徐老七殿后被薛综部斩为肉泥。
崇祯九年十月十七日，中兴福烈帝徐鸿儒伤重毙命，大元帅徐三姐收拾到残部不足一万人，后勤辎重家属教民几乎损失怡尽，在颍上被追来的河南副将陈永福一阵厮杀，徐三姐只带着三千多轻骑逃往中都凤阳府。
崇祯九年十月，福建参将郑芝豹得到援军后，配合浙江、河南官军围剿“奉天正义大元帅”所部，三路大军属河南方面的薛家军最为彪悍，薛十三、薛综和新加入的薛博部，追着“奉天正义大将军”黄希达打。
黄希达虽然拥有四万军队，可面对薛十三、薛综、薛博的八千人马竟然七战七败，四万人马剩下不足一万人，而大本营金华府也被福建官军攻破，“奉天正义大元帅”白衣书生下落不明，至此黄希达开始在浙江打游击，有的黄家子弟也暗中联络家主黄希圣。
第842章 朝鲜降清
崇祯九年十二月二日，皇太极以朝鲜大王李倧拒不接见大清使团，不接受其国书，朝鲜使臣罗德宪、李廓参加皇太极在沈阳正式举行的称帝大典拒不下拜为由，皇太极派济尔哈朗守盛京，阿济格、阿巴泰守辽河入海口以遏薛家军、明军，令多尔衮、豪格分统左翼满洲、蒙古兵，从宽甸入长山口；户部承政马福塔等率兵三百人突袭朝鲜王都，多铎、岳托等人率数千兵马接应，皇太极亲自与大贝勒代善率其他各路人马共十二万大军征伐朝鲜。
清军渡江后，扬野战之长，舍坚城而不攻，长驱而南下，仅仅十二天便抵达朝鲜京城下，京畿之内“上下惶惶，罔知所为，都城士大夫，扶老携幼，哭声载路”；朝鲜大王李倧再次将王妃、王子和大臣妻子送往江华岛避难，自己则率领文武百官退守南汉山城，同时派出崔鸣吉等人赴清营谈判拖延时间，等待各路勤王军的到来。
这时朝鲜大帅张晚已经病逝，出任主将的李贵一面率领四万大军勤王，一面向在旅顺的薛家军求救，因为是兵马万户伊朝芳的防区被建虏突破，急于将功赎罪的伊朝芳未到朝鲜京城，就被岳托、豪格消灭了，吓得李贵率部躲回平壤再也不敢出城。
李贵、伊朝芳的人马是朝鲜最精锐的，现在李贵、伊朝芳的人马一败，整个朝鲜根本没有能跟建虏一战的军队，各路勤王军都畏惧不前，崇祯十年正月，清兵先后击败全罗道、忠清道等地的援军后，朝鲜大王李倧真心向清军求和。
皇太极恐朝鲜再次反清，遣多尔衮袭破江华岛，俘虏朝鲜王妃、王子、宗室、群臣家属，皇太极要求朝鲜大王李倧出城投降，朝鲜大王李倧得知江华岛失陷，知道大势已去只好求和。崇祯十年年正月三十日，朝鲜大王李倧脱去王服改穿青衣率领群臣出南汉山城，徒步前往汉江东岸的三田浦清营向皇太极行三跪九叩之礼请罪。皇太极降旨赦之。
双方筑坛盟誓，朝鲜去明年号，缴纳明朝所赐诰命敕印，奉清朝为正朔，定时贡献，并送质子二人。此外朝鲜大王李倧亲明反清的主要人物弘文馆校理尹集、修撰吴达济及台谏官洪翼汉缚献清军，三人后来在盛京被建虏杀害。
满清和朝鲜双方签订和议：朝鲜大王李倧以长子李溰、次子李淏赴清朝作人质，每年黄金百两、白银千两、水牛角二百对、貂皮百张、鹿皮百张、茶千包、水獭皮四百张、青黍皮三百张、胡椒十斗、腰刀二十六口、顺刀二十口、苏木二百斤、大纸千卷、小纸千五百卷、五爪龙席四领、花席四十领、白苎布二百疋、绵绸二千疋、细麻布四百疋、细布万疋、布四千疋、米万包。
满清还不满意，将五十万朝鲜人作为俘虏押回国充作奴隶，并掠走朝鲜大量物资，后来朝鲜大王李倧向满清支付赎金赎回了一些人；朝鲜被迫与明朝和薛家军断交，接受满清的册封，成为清朝的藩属国，皇太极命令朝鲜出兵旅顺，朝鲜大王李倧出战船五十艘协助满清攻打旅顺的薛家军。
旅顺的薛家军得知建虏进攻朝鲜，还是捐弃前嫌出兵助战，陆要金、左明、游参将出兵辽东，阿济格、阿巴泰率领正黄旗、正蓝旗固守，薛家军虽然小有斩获，却不想朝鲜已经向满清投降了。